Setelah dibebaskan, Sjafruddin cenderung untuk mengekspresikan diri lebih jauh melalui agama, berkhotbah terhadap korupsi di bawah Suharto, dan mengetuai Petisyen Lima Puluh, dan menentang konsep Pancasila sebagai satu-satunya prinsip panduan untuk semua kelompok, khususnya agama di Indonesia. Pada 7 Julai 1983 beliau menulis surat terbuka kepada Suharto untuk membantah terhadap peruntukan undang-undang draf yang menyokong konsep tersebut. [8] Oleh kerana kegiatan ini, Suharto melarang Sjafruddin meninggalkan negara ini kecuali untuk rawatan perubatan.[9]